是985。1994年，南京大學被確定為國家“211工程”重點支持的大學；1999年，南京大學進入國家“985工程”首批重點建設的高水大學行列。

江蘇211大學：南京大學、東南大學、蘇州大學、南京師范大學、中國礦業大學、中國藥科大學、河海大學、南京航空航天大學、江南大學、南京農業大學、南京理工大學。江蘇有2所985大學，分別是南京大學、東南大學。

2006年，教育部和江蘇省再次簽訂重點共建南京大學的協議；2011年，教育部和江蘇省簽署協議繼續重點共建南京大學；2016年，南京大學入選首批國家級雙創示范基地；2017年，南京大學入選A類世界一流大學建設高校名單，15個學科入選世界一流學科建設名單。