福建雙一流大學有兩所，分別是福州大學和廈門大學。廈門大學是中國代教育史上第一所華僑創(chuàng)辦的大學，也是國家“211工程”和“985工程”重點建設(shè)的高水大學。

廈門大學設(shè)有研究生院、6個學部以及30個學院和16個研究院，形成了包括人文科學、社會科學、自然科學、工程與技術(shù)科學、管理科學、藝術(shù)科學、醫(yī)學科學等學科門類在內(nèi)的完備學科體系。學校現(xiàn)有18個學科進入ESI全球前1%，擁有5個一級學科國家重點學科、9個二級學科國家重點學科。

福州大學是國家“雙一流”建設(shè)高校、國家“211工程”重點建設(shè)大學、福建省人民政府與國家教育部共建高校。學校創(chuàng)建于1958年，現(xiàn)已發(fā)展成為一所以工為主、理工結(jié)合，理、工、經(jīng)、管、文、法、藝等多學科協(xié)調(diào)發(fā)展的重點大學。學校現(xiàn)設(shè)89個本科專業(yè)；38個一級學科碩士點、21個碩士專業(yè)學位授權(quán)點；11個一級學科博士點、2個二級學科博士點（不含一級學科覆蓋）；11個博士后科研流動站。學校擁有1個國家重點學科、1個國家重點(培育)學科，“化學科學與工程學科群”入選國家公布的世界一流學科建設(shè)名單，化學學科進入國際ESI學科排名前1‰，4個學科進入國際ESI學科排名前1%。